動物RNAout(TRIzol)/KLANG
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動物RNAout(TRIzol)
產(chǎn)品及特點
本產(chǎn)品是類似于 基于異硫氰酸胍/酚/氯仿提取原理的快速總 RNA 提取試劑,可用于從各種動物組織(包括白細胞)和部分植物材料中 快速提取總 RNA。
1. 操作簡單快速,只要 10 分鐘左右,可以全在室溫下進行。
2. RNA 質(zhì)量高,OD260/OD280 一般在 1.9 左右。一般不含用 RT-PCR 可以檢測到的基因組 DNA 污染。
3. 適用于大部分實驗材料,如培養(yǎng)細胞、各種動物材料和少數(shù)植物材料。 植物 RNA 的提取好使用天澤基因的植物 RNAOUT。
4. 性價比高于進口 和 TRI Reagent 等同類產(chǎn)品。
規(guī)格及成分 成 份 編 號 小立盒包裝
動物 RNAout LM3070a 100 mL(廣口棕色玻璃瓶 使用手冊 LM3070sc 1 份
運輸及保存 常溫運輸,4℃保存,有效期一年。
自備試劑 氯仿、異丙醇、75%乙醇、RNase-free 水。
使用方法
注意:下面的操作步驟是用 1 mL 本產(chǎn)品進行的微量提取的,細胞使用量一 定要準確,不能超過下述用量,否則將超出本產(chǎn)品的裂解能力,RNA 產(chǎn)量 將急劇降低。如果樣品量大,請按比例增加各成份的用量。RNA 工作環(huán)境 好用高效無毒的固相 RNase 清除劑(CAT#:3080)徹底處理。
1. 對貼壁細胞(10 平方厘米):吸盡培養(yǎng)液,加入 1 mL 的本產(chǎn)品用槍充 分吹打確保細胞全部裂解,然后將裂解液轉(zhuǎn)移至干凈的 1.5 mL 塑料離 心管中,進入第 6 步。
2. 對懸浮細胞(五百萬至一千萬個):離心收集細胞,吸盡液體,加入 1 mL 本產(chǎn)品,用槍充分吹打確保細胞全部裂解,然后將裂解液轉(zhuǎn)移到干凈的 1.5 mL 塑料離心管中,進入第 6 步。
3. 對新鮮組織(50-100 mg):將新鮮組織剪切成小塊,放入 10 mL 或 15 mL 塑料離心管中,加入 1 mL 的本產(chǎn)品,用 Polytron 剪切式勻漿 器冰上勻漿 30 秒左右,將勻漿液轉(zhuǎn)移至新的 1.5 mL 塑料離心管中, 進入第 6 步。注意:對肝、脾、胰、腎等細胞分裂十分旺盛的組織(細 胞中含大量正在復制的 DNA),使用量不要超過 30-50 mg,否則十分 容易產(chǎn)生 DNA 污染。對 10 mg 以下的組織,好加入本公司的微量 RNA 助沉劑。
4. 對 RNALOCKER保存的組織(50-100 mg):先用紙吸去 RNALOCKER液 體后再剪切成小塊,其余操作同第 3 步。RNALOCKER 處理后的組織韌 性很強,勻漿時間需要適當延長。
5. 對液氮中保存的組織(50-100 mg):在研缽中研磨成粉,加入 1 mL 本產(chǎn)品,用槍充分吹打確保細胞全部裂解,然后將裂解液轉(zhuǎn)移到干凈的 1.5 mL 塑料離心管中,進入第 6 步。
6. 在裝有裂解物/勻漿物的 1.5 mL 塑料離心管中加入 0.2 mL 自備氯仿, 振蕩器上充分振蕩混均 30 秒。注意:一定要把官底的溶液震蕩起來, 否則只是液面的振動。
7. 13000-15000 g 室溫離心 3 分鐘。
8. 將上清液(約 0.6 mL)轉(zhuǎn)移到另一干凈的 1.5 mL 塑料離心管中。下 層有機相(藍色)和中間層含有 DNA 和蛋白質(zhì),避免觸及,否則將產(chǎn) 生蛋白質(zhì)和 DNA 污染。為保險起見,可以留下 50-100uL 上清液不取。
9. 對脂類豐富的組織(如脂肪組織和腦組織),需再重復氯仿抽提一到兩 次以讓氯仿充分去除脂類分子。
10. 在上清液中加入等體積的異丙醇,振蕩器上振蕩 30 秒混勻。
11. 13000-15000 g 室溫離心 5 分鐘,離心底的側(cè)面將形成 RNA 沉淀。 如果組織使用量低于 10 mg 或需要提高 RNA 回收率,可以將離心時 間延長到 20 或 30 分鐘。
12. 小心吸棄上清液,注意不要吸棄 RNA 沉淀。
13. 在含 RNA 沉淀的離心管中加入 1mL 75%乙醇,振蕩混勻 30 秒。
14. 13000-15000 g 室溫離心 1 分鐘。
15. 小心吸棄上清液,注意不要吸棄 RNA 沉淀。
16. 重復第 13-15 的洗滌步驟一次(也可以省略)。
17. 短暫快速離心,用移液槍小心吸棄殘留乙醇(約 50 uL)。注意不要吸棄 RNA 沉淀。此步十分重要,否則殘留的乙醇會影響 RNA 的后續(xù)使用。
18. 室溫放 1-2 分鐘后立即加入 50-100 uL RNase-free 水使 RNA 沉淀溶 解。千萬不要用真空離心法使 RNA 沉淀過于干燥,否則 RNA 將變得 十分難溶。RNA 樣品可以立即使用或存放于-80℃待用。 注意:由于 RNase-free 水沒有主動滅活殘留 RNase 的功能,而任何 方法提取的 RNA 都可能有殘留的 RNase,所以強烈建議客戶使用本公 司推出的具有主動滅活殘留 RNase 功能的、同時跟后續(xù) RT-PCR 等反 應兼容的液相 RNase 清除劑(CAT#:3091)。
附一:RNA 完整性的電泳檢測(僅供參考,本產(chǎn)品不含相關試劑) 如果需要做 Northern 雜交,強烈建議用戶使用甲醛變性膠進行 RNA 電泳,因為非變性膠不能分離所有的 RNA 分子(BioTechniques,28: 414,2000)。如果是簡單檢測,可以使用 TAE 緩沖液或超快核酸電泳液 進 行 常 規(guī)電 泳 ,但 文獻 報 道 必須 使用 RNAon 這 樣 的變 性 上樣 液 (BioTechniques,9:558,1990)。普通 DNA 上樣液不含變性劑,也 沒經(jīng)過去 RNase 處理,所以好不要使用,否則 RNA 容易降解。 動物 RNA 電泳后應該在 UV 下呈現(xiàn)三條清晰的 rRNA 帶,28S rRNA 條 帶的熒光強度一般比 18S rRNA 條帶的熒光強度強 1.5-2.3 倍。如果這兩 條 rRNA 帶不清晰或比例小于此范圍則表示 RNA 有降解(因為大的 RNA 被酶降解的可能更大)。
跟動物一樣,植物果實和種子的 RNA 一般有三條電泳帶,但植物葉片 的 RNA 有四條或更多 rRNA 帶,多余的 RNA 來源于葉綠體。
如果電泳發(fā)現(xiàn) RNA 樣品中有 DNA 污染(一般是使用過多樣品造成), 可分別用天澤基因的非酶 DNA 清除劑或 RNase-free DNase 清除。
附二:RNA 產(chǎn)量和純度測定(僅供參考,本產(chǎn)品不含相關試劑)
用 pH 在 7.5-8.2 的 TE 緩沖液將 5-10 μL RNA 稀釋 10-20 倍后在 OD260 和 OD260 測光吸收,通過光吸收可以得出 RNA 濃度(1 OD260 的 RNA=40 μg/mL),進而計算出 RNA 的產(chǎn)量(濃度×體積)和產(chǎn)率(RNA 產(chǎn)量/組織用量)。RNA 的產(chǎn)率還隨組織的營養(yǎng)狀態(tài)和組織的種類不同而不 同,一般來說,代謝旺盛的組織(如肝臟和腎臟)RNA 的產(chǎn)率高,代謝不旺盛 的組織(如肌肉和脂肪組織)RNA 的產(chǎn)率低,下面是常見動物組織 RNA 產(chǎn)率: 肌肉,胎盤和腦組織:1-2 μg RNA/mg 組織 肝,胰和腎組織: 5-10 μg RNA/mg 組織 培養(yǎng)細胞: 5-15 μg/10E6 細胞 RNA 的純度通過 OD260/OD280 來確定,一般在 1.8-2.1 之間即算 合格。但即使低于此范圍,一般也不會影響 RT-PCR 等反應。
蛋白質(zhì)污染可以通過酚/氯仿抽提一次然后酒精沉淀去除,多糖污染可 以用天澤基因的多糖清除劑去除。 關聯(lián)產(chǎn)品 RNADOWN、、液相 RNase 清除劑、固相 RNase
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