次氯酸鈉發(fā)生器的滅菌殺病毒原理大致有如下三種作用方式：

次氯酸鈉發(fā)生器消殺最主要的作用方式是通過它的水解形成次氯酸，次氯酸再進(jìn)一步分解形成新生態(tài)氧[O]，新生態(tài)氧的極強(qiáng)氧化性使菌體和病毒上的蛋白質(zhì)等物質(zhì)變性，次氯酸鈉發(fā)生器從而致死病源微生物。其實(shí)，氯氣消毒的原理也主要是以產(chǎn)生出次氯酸，然后釋放出新生態(tài)氧[O]的方式。

根據(jù)化學(xué)測定，PPM級濃度的次氯酸鈉發(fā)生器在水里幾乎是完全水解成次氯酸，次氯酸鈉發(fā)生器其效率高于99.99%。其過程可用化學(xué)方程式簡單表示如下：

NaClO + H2O ＝ HClO + NaOH

HClO → HCl + [O]

其次，次氯酸在殺菌、殺病毒過程中，次氯酸鈉發(fā)生器不僅可作用于細(xì)胞壁、病毒外殼，而且因次氯酸分子小，不帶電荷，還可滲透入菌（病毒）體內(nèi)，與菌（病毒）體蛋白、核酸、和酶等有機(jī)高分子發(fā)生氧化反應(yīng)，次氯酸鈉發(fā)生器從而殺死病原微生物。