硫酸軟骨素（CS），是共價連接在蛋白質(zhì)上形成蛋白聚糖的一類糖胺聚糖。硫酸軟骨素廣泛分布于動物組織的細胞外基質(zhì)和細胞表面，糖鏈由交替的葡萄糖醛酸和N-乙酰半乳糖胺聚合而成，通過一個似糖鏈接區(qū)連接到核心蛋白的絲氨酸殘基上。

雖然多糖的主鏈結(jié)構(gòu)并不復雜，但就硫酸化程度、硫酸基和兩種差異向異構(gòu)糖醛酸再鏈內(nèi)的分布來說，呈現(xiàn)高度的不均一性。硫酸軟骨素的精細結(jié)構(gòu)決定著功能的特異性和與多種蛋白質(zhì)分子的相互作用。