環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)分為生活污水、工業(yè)廢水、除塵脫硫脫硝、工業(yè)廢氣、工業(yè)固體廢物（不含危險(xiǎn)廢物）、有機(jī)廢物、生活垃圾、自動連續(xù)監(jiān)測等類別。
自動連續(xù)監(jiān)測設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)分為乙級資質(zhì)和臨時資質(zhì)兩個級別，其他環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)分為資質(zhì)、乙級資質(zhì)和臨時資質(zhì)三個級別。
第五條 【監(jiān)督管理】 環(huán)境保護(hù)主管部門對環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營實(shí)施統(tǒng)一監(jiān)督管理，并對省級環(huán)境保護(hù)主管部門的環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營管理活動進(jìn)行和監(jiān)督。
縣級以上地方環(huán)境保護(hù)主管部門對環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)持證單位（以下簡稱持證單位）及其運(yùn)營活動實(shí)施監(jiān)督管理。
第六條 【運(yùn)營培訓(xùn)】 從事環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營的現(xiàn)場管理人員和現(xiàn)場操作人員，應(yīng)當(dāng)按照環(huán)境保護(hù)主管部門的規(guī)定，參加的培訓(xùn)與考核。
環(huán)境保護(hù)主管部門制定統(tǒng)一的環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營現(xiàn)場管理人員和現(xiàn)場操作人員培訓(xùn)、考核規(guī)范。省級環(huán)境保護(hù)主管部門負(fù)責(zé)組織環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營現(xiàn)場管理人員和現(xiàn)場操作人員的培訓(xùn)、考核
【資質(zhì)重新申請】 有下列情形之一的，持證單位應(yīng)當(dāng)按照本辦法規(guī)定的條件和程序,向原發(fā)證機(jī)關(guān)重新申請環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)：
（一）增加新的運(yùn)營類別的；
（二）臨時資質(zhì)升級為資質(zhì)或者乙級資質(zhì)的；
（三）乙級資質(zhì)升級為資質(zhì)的；
（四）資質(zhì)有效期滿而未獲延續(xù)的。
環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營臨時資質(zhì)有效期滿，不符合升級為資質(zhì)或者乙級資質(zhì)條件的，2年內(nèi)不得重新申請同類別的臨時資質(zhì)。

【資質(zhì)有效期及其延續(xù)】 環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)和乙級資質(zhì)有效期為5年，臨時資質(zhì)有效期為2年。
持證單位在環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)或者乙級資質(zhì)有效期內(nèi)的各年度管理考核中，沒有違反法律法規(guī)或者違反本辦法規(guī)定的行為，可以在資質(zhì)有效期滿前60日內(nèi)，向原發(fā)證機(jī)關(guān)申請資質(zhì)延續(xù)，換發(fā)證書。
環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營臨時資質(zhì)有效期滿后自動失效，不予延續(xù)。具備相應(yīng)條件的，臨時資質(zhì)持證單位可以按照本辦法第七條、第八條的規(guī)定，申請乙級資質(zhì)或者資質(zhì)。

【資質(zhì)效力】 環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)、乙級資質(zhì)和臨時資質(zhì)全國通用。各地不得在環(huán)境保護(hù)主管部門規(guī)定的條件之外，以任何名義設(shè)置資質(zhì)審批前置條件，也不得在審批過程中收取任何費(fèi)用。
集團(tuán)公司和具備立法人的分公司，應(yīng)當(dāng)依照本辦法的規(guī)定，分別申請環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)。
環(huán)境污染治理設(shè)施所在地環(huán)境保護(hù)主管部門不得要求持證單位及其非立法人的分公司重復(fù)申領(lǐng)運(yùn)營資質(zhì)證書或者申請其他類似的運(yùn)營許可。
環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)不得轉(zhuǎn)讓。禁止、變造環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)證書。

運(yùn)營管理
第十七條【運(yùn)營要求】 持證單位可以按照環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)證書規(guī)定的類別，在全國范圍內(nèi)承接環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營業(yè)務(wù)。
第十八條【技術(shù)評估】 持證單位接受環(huán)境污染治理設(shè)施委托運(yùn)營前，應(yīng)當(dāng)對該設(shè)施是否具備穩(wěn)定運(yùn)行和達(dá)標(biāo)排放的必要條件進(jìn)行技術(shù)評估，并以此作為簽訂委托服務(wù)合同的依據(jù)。
第十九條【委托運(yùn)營合同】 持證單位從事環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營活動，應(yīng)當(dāng)與委托單位簽訂委托運(yùn)營合同，明確雙方的權(quán)利和義務(wù)。
持證單位應(yīng)當(dāng)在委托運(yùn)營合同簽訂后30日內(nèi)，填寫環(huán)境污染治理設(shè)施委托運(yùn)營項(xiàng)目備案表，報(bào)設(shè)施所在地縣級環(huán)境保護(hù)主管部門備案。
第二十條【對持證單位要求】 持證單位應(yīng)當(dāng)依照委托運(yùn)營合同的約定和國家有關(guān)環(huán)境保護(hù)的規(guī)定，保證環(huán)境污染治理設(shè)施正常運(yùn)行，確保排放的污染物符合國家和地方規(guī)定的污染物排放標(biāo)準(zhǔn)，防止產(chǎn)生環(huán)境污染。
第二十一條【年度評估】 持證單位應(yīng)當(dāng)在每年12月31日前對所運(yùn)營的環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)行狀況、設(shè)施完好情況、污染物排放達(dá)標(biāo)情況、二次污染防治情況、設(shè)施運(yùn)行中存在的問題及其整改方案等進(jìn)行年度評估，并填寫環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營情況年度報(bào)告表。
第二十二條【運(yùn)行考核】 省級環(huán)境保護(hù)主管部門負(fù)責(zé)對在本行政區(qū)域內(nèi)登記的持證單位及其運(yùn)行的環(huán)境污染治理設(shè)施項(xiàng)目情況進(jìn)行年度管理考核。
第二十四條【運(yùn)行監(jiān)督】 縣級以上環(huán)境保護(hù)主管部門應(yīng)當(dāng)按照屬地管理的原則，將對環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營活動的管理納入日常執(zhí)法工作范圍，依照有關(guān)法律、法規(guī)和本辦法的規(guī)定，通過書面檢查和實(shí)地核查等方式，對持證單位的運(yùn)營活動進(jìn)行監(jiān)督檢查，并將監(jiān)督檢查情況和處理結(jié)果予以記錄，由監(jiān)督檢查人員簽字后存檔；發(fā)現(xiàn)違法行為的，責(zé)令其限期整改，依法予以查處，并通報(bào)環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)發(fā)證機(jī)關(guān)。
異地運(yùn)營的持證單位發(fā)生違法行為時，違法行為發(fā)環(huán)境保護(hù)主管部門在依法查處的同時，應(yīng)當(dāng)將違法事實(shí)、處理結(jié)果等情況，向其環(huán)境污染治理設(shè)施運(yùn)營資質(zhì)發(fā)證機(jī)關(guān)通報(bào)。
第二十五條【措施】 環(huán)境保護(hù)主管部門履行監(jiān)督檢查職責(zé)時，除可以依法采取有關(guān)監(jiān)督檢查措施外，還可以要求被檢查的持證單位提供運(yùn)營資質(zhì)證書正本或者副本原件、技術(shù)人員書復(fù)印件、現(xiàn)場管理人員和現(xiàn)場操作人員崗位培訓(xùn)證書、勞動關(guān)系、有關(guān)運(yùn)營業(yè)務(wù)的文檔、內(nèi)部管理制度文件、運(yùn)行檢測和運(yùn)行操作記錄、設(shè)施運(yùn)行評估報(bào)告等材料，并進(jìn)入被檢查的持證單位及其負(fù)責(zé)運(yùn)行的設(shè)施進(jìn)行現(xiàn)場核查。
縣級以上環(huán)境保護(hù)主管部門進(jìn)行日常監(jiān)督和現(xiàn)場核查時，持證單位應(yīng)當(dāng)如實(shí)報(bào)告設(shè)施運(yùn)行情況，提供相關(guān)資料，不得以任何理由阻礙檢查，不得隱瞞真實(shí)情況，不得提供虛假數(shù)據(jù)和資料。